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課程名稱 |
生物學的R程式語言
R Programming for Biology |
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開課學期 |
111-1 |
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授課對象 |
生命科學院 生命科學系 |
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授課教師 |
麥德倫 |
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課號 |
LS5118 |
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課程識別碼 |
B21 U2620 |
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班次 |
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學分 |
2.0 |
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全/半年 |
半年 |
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必/選修 |
選修 |
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上課時間 |
星期二6,7(13:20~15:10) |
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上課地點 |
生科419 |
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備註 |
最好能自備筆電，須能自行安裝相關套件。限生科院、公衛學院、生農學院與醫學院等生物相關學生選修
總人數上限：25人 |
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課程簡介影片 |
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核心能力關聯 |
本課程尚未建立核心能力關連 |
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課程大綱
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為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
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課程概述 |
本課程以生命科學系的學生為主要授課對象，藉由學習基本的Linux操作指令與R程式語言，來讓學生了解基本的程式設計觀念，數據上則會使用生命科學方面如生態學或流行病學等數據，讓學生日後對於其他課程需要資料分析或作圖奠定良好的基礎。為增加學生實作能力，課程會有實作練習時間，先由教師進行基本上課教學進度，再由學生練習並討論可能的撰寫方式，教師會給予提示與指導，以期學生能由實作中對上課內容有更深入的理解。 |
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課程目標 |
本課程為生命科學系領域專長之系統生物學領域Level 1基礎課程，課程目標是作為生物資訊學的前備課程，對象主要為沒有任何程式經驗的學生。預期學生將學會程式設計的基本概念與其在生物學上的應用，並接觸到基本Linux作業系統的基本指令與操作，R語言在資料分析與視覺化的應用等等。 |
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課程要求 |
● 基本電腦操作與軟體安裝能力(建議自備筆電，須能自行安裝相關套件)
● 建議預修課程：無須先修課程。 |
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預期每週課後學習時數 |
2-4小時 |
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Office Hours |
另約時間 |
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指定閱讀 |
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參考書目 |
[1] Zuur, A., Ieno, E. N., & Meesters, E. (2009). A Beginner's Guide to R. Springer Science & Business Media.
[2] Wickham, H., & Grolemund, G. (2016). R for data science: import, tidy, transform, visualize, and model data. O'Reilly Media, Inc. |
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評量方式
(僅供參考) |
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No. |
項目 |
百分比 |
說明 |
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1. |
期中考 |
40% |
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2. |
期末書面報告 |
30% |
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3. |
期末口頭報告 |
30% |
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針對學生困難提供學生調整方式 |
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上課形式 |
提供學生彈性出席課程方式, 以錄影輔助 |
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作業繳交方式 |
書面報告取代口頭報告, 學生與授課老師協議改以其他形式呈現 |
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考試形式 |
書面(口頭)報告取代考試 |
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其他 |
由師生雙方議定 |
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週次 |
日期 |
單元主題 |
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第1週 |
9/06 |
程式設計的基本介紹 |
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第2週 |
9/13 |
Linux系統下的基本指令與操作 (I) |
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第3週 |
9/20 |
Linux系統下的基本指令與操作 (II) |
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第4週 |
9/27 |
Linux系統下的基本指令與操作 (III) |
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第5週 |
10/04 |
R語言的基本介紹 |
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第6週 |
10/11 |
R語言的資料輸入與變量 |
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第7週 |
10/18 |
R語言的基本繪圖工具 |
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第8週 |
10/25 |
期中考試 |
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第9週 |
11/01 |
R語言的條件、迴圈與函數 (I) |
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第10週 |
11/08 |
R語言的條件、迴圈與函數 (II) |
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第11週 |
11/15 |
校慶停課(依行事曆) |
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第12週 |
11/22 |
R語言的條件、迴圈與函數 (III) |
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第13週 |
11/29 |
R語言的進階繪圖工具 |
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第14週 |
12/06 |
R語言的生物學應用 |
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第15週 |
12/13 |
期末專題報告(線上) |
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第16週 |
12/20 |
期末專題報告(實體) |
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